Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms