Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms