Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms