Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPACA9Q96E40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms