Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms