Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRIM63Q969Q1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRIM63Q969Q1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRIM63Q969Q1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRIM63Q969Q1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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