Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms