Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms