Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF398Q8TD17 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF398Q8TD17 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms