Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms