Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC18Q8N456 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms