Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms