Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms