Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms