Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R42Q7Z4L9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms