Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APTXQ7Z2E3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms