Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms