Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TREML4Q6UXN2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms