Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms