Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms