Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms