Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms