Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms