Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms