Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms