Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PERM1Q5SV97 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PERM1Q5SV97 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms