Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms