Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms