Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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