Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms