Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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