Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms