Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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