Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM187BQ17R55 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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