Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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