Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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