Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FXNQ16595 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FXNQ16595 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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