Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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