Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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