Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATXN8Q156A1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms