Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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