Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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SIX1Q15475 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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SIX1Q15475 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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SIX1Q15475 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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SIX1Q15475 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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