Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms