Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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