Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PDK1Q15118 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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