Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms