Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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