Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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COL4A6Q14031 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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COL4A6Q14031 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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