Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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