Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CAMK2DQ13557 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2DQ13557 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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